شهریه مدارس غیرانتفاعی برای ارائه امکانات مختلف و نیز هزینه‌های متفاوت این مدارس، از دانش‌آموزان هر مقطع تحصیلی دریافت می‌شود. افراد می‌توانند با استعلام هزینه مدرسه غیردولتی ۱۴۰۳-۱۴۰۲ در سامانه www.mosharekatha.ir از میزان مبلغ قابل پرداخت برای شهریه مدارس غیرانتفاعی اطلاعات لازم را کسب کنند. عوامل تأثیرگذار بر میزان شهریه مدارس غیر انتفاعی ۱۴۰۳-۱۴۰۲ می‌تواند شامل میزان ساعات آموزشی، تعداد ساعات آموزش‌های فوق برنامه و مازاد، کلاس‌های آموزشی تخصصی، امکانات مربوط به تغذیه و رفت‌وآمد دانش‌آموزان، وجود امکانات آزمایشگاهی، کارگاهی و همایش‌های آموزشی و شرایط اقتصادی هر منطقه است.